重複檔案與系統垃圾，是兩件事
重複檔案搜尋找的是相同內容；系統清理則處理由 Windows 管理的暫存檔、更新資源或不再需要的應用程式。DUPESPACE 不推測哪些 Windows 系統檔可以刪除，也不提供登錄檔清理。
若目的是整理系統暫存，請使用 Windows 設定中的儲存體、清理建議或儲存空間感知，並逐項查看內容。若目的是整理重複下載、照片或影片，才開始比對個人資料夾。
從明確的一個資料夾開始
不要第一次就把整個磁碟當成清理目標。先選擇用途清楚的下載資料夾、照片匯入目錄或手動複製的資料。DUPESPACE 遞迴掃描你加入的位置，不會主動擴大到整台電腦。
需要保留的工作資料夾可以設為保護子資料夾。Windows 版先套用保護規則，再依可判定的建立時間與路徑提出保留建議；建立時間也可能因複製或還原而改變，仍須由你核對用途。
專案、套件與備份不能只看重複
不同程式碼專案可能各自需要同一份設定檔、外掛或依賴套件。工具會排除辨識到的專案與套件環境，但不可能知道每個自訂程式的所有相依關係。不要因為檔案內容相同，就假設另一個位置不再需要。
同步資料夾與備份也有類似風險。刪除同步位置的檔案可能由同步軟體傳播到其他裝置；NAS 或網路磁碟未必提供 Windows 資源回收筒。確認儲存位置的行為與備份策略，再考慮整理。
核對、少量測試，再批次處理
先檢查群組的檔名、完整路徑、預覽與保留標記。使用少量測試資料驗證操作，再處理更大的批次。整理期間避免其他程式修改目標資料夾，因為變更會使原先的掃描結果失效。
預設使用資源回收筒。若操作失敗或檔案已變更，DUPESPACE 會記錄結果，不會把垃圾桶失敗自動轉為永久刪除。完成後查看 CSV 的各筆狀態，不要只看總容量。CSV 可能含私人路徑，公開回報前請先遮蔽。